2025年9月10日，中国国务院正式批复同意新建黄岩岛国家级自然保护区，总面积3523.67公顷。 该保护区位于海南省三沙市，其中核心区面积1242.55公顷，实验区面积2281.12公顷，主要保护对象为珊瑚礁生态系统。 国家林业和草原局当晚发布公告，明确了保护区面积、范围及功能区划。

黄岩岛是一个略呈等腰三角形的大环礁，东西长15千米，南北宽15千米，周边长约55千米，面积约150平方千米（包括潟湖）。其潟湖面积约130平方千米，水深最深约20米，拥有丰富的珊瑚礁生态系统和渔业资源。

此次划定的保护区主要集中在黄岩岛环礁的东北半部，而西部、南部广阔区域以及潟湖内部并未纳入保护范围。 这种规划被分析人士视为战略布局，为未来可能的填海造陆和基础设施建设预留了空间。

根据《中华人民共和国自然保护区条例》，自然保护区的核心区禁止任何单位和个人进入（除经批准的科学研究活动外），实验区则可以进入从事科学试验、教学实习、参观考察等活动。

设立自然保护区后，中国海警执法依据更加充分。 根据《海洋环境保护法》和《海警法》，任何未经批准进入保护区的行为都可能被视为非法捕捞、破坏生态或危害国家安全，海警可依法实施登临检查、扣押船只等行动。

2024年7月发布的《黄岩岛海域生态环境状况调查评估报告》显示，该海域环境质量优，珊瑚礁生态系统健康。 相比之下，《仁爱礁生态破坏调查报告》指出因菲军舰长期锈蚀、排污，仁爱礁珊瑚覆盖率大幅下降，重金属污染严重。

菲律宾近年来多次在黄岩岛海域进行挑衅。 2025年8月，菲方海警小艇曾非法闯入黄岩岛潟湖区域，甚至试图在礁盘上插旗。 中方出动舰艇依法拦截并驱离。

菲律宾自2012年以来多次指控中国渔民在黄岩岛附近海域使用氰化物非法捕鱼，破坏珊瑚礁。 2024年5月，菲方还要求中国开放黄岩岛让国际社会监督环境问题。

中国南海研究院专家指出，设立自然保护区既是回应外界对中国破坏南海生态环境的指责，也通过法律手段进一步巩固了对黄岩岛海域的主权。

自然资源部海洋发展战略研究所副所长徐贺云表示，黄岩岛海域造礁石珊瑚种类丰富，所有珊瑚都是中国国家二级保护野生动物，41种被列入《世界自然保护联盟濒危物种红色名录》近危物种，14种被列为易危物种。

黄岩岛海域面临的生态挑战包括海水温度升高导致珊瑚白化、极端天气威胁、长棘海星等敌害生物暴发的可能性，以及渔业活动产生的生活污水和废弃物对珊瑚礁生态系统的威胁。

菲律宾2024年11月出台《海洋区域法》和《群岛海道法》，试图将黄岩岛和南沙大部分岛礁非法划入菲律宾管辖范围。 中国随即公布黄岩岛领海基线，重申对该岛的主权。

2025年8月11日，菲律宾海警称中国海警船向菲船发射水炮，并在追逐菲国巡逻船时与中国海军军舰相撞。 美国“希金斯”号驱逐舰8月13日出现在同一片海域，中国海军称已对其进行警告并驱离。

菲律宾武装部队总参谋长罗密欧·布劳纳在2025年8月22日宣布：任何导致菲律宾军人死亡的行动都将被视为战争行为，菲军将依据国际交战规则予以坚决回击。 菲海军还明确两条红线：中方不得移动或破坏“马德雷山号”；任何菲方人员伤亡都将自动触发《美菲共同防御条约》。

分析认为，菲律宾近期强硬姿态背后既有转移国内经济困境的考量，也有配合美国遏制中国的地缘算计。 但将南海问题过度国际化、军事化可能使地区局势陷入恶性循环。

中国国防部发言人张晓刚在8月29日的记者会上严正警告：菲律宾方面勾结域外势力、肆意挑衅的行为，终将自食其果。 同日，中国南部战区海军多艘舰艇组成特混编队在南海展开实战化演练。

黄岩岛战略位置重要，是南海东部门户和控制南海的战略要地。 一旦进行填岛建设，将彻底填补中国在南海岛礁体系中的最后空白，形成对菲律宾吕宋岛西海岸的战略压制。

美国在太平洋中西部设有太平洋偏远岛屿海洋国家纪念区，在西太平洋设有马里亚纳海沟国家海洋纪念区。 日本设立了小笠原群岛国家公园，菲律宾自己也设有阿波岛海洋保护区。

东盟国家对黄岩岛自然保护区一事大多保持“谨慎沉默”。 中国通过生态议题切入，避免了“胁迫”形象，赢得了地区国家的理解和默认。

菲律宾总统海事事务助理森蒂诺9月初曾表示，菲方正在更新“交战规则”，包括关于何时以及如何“使用武力”的具体规定，以应对中国在南海的所谓“非法”活动。

中国海警最新视频显示，菲律宾快艇在仁爱礁海域连续两日故意以危险方式逼近中方船只进行挑衅。 中国海警依法驱离管制，菲方却反咬一口在国际媒体上炒作“中方危险动作”。

1999年，菲律宾以“船体故障”为由将“马德雷山号”坦克登陆舰故意搁浅在仁爱礁，企图通过实际存在强化主权声索。 二十多年来，该舰逐渐锈蚀，菲方近年试图运送建材进行加固，但遭到中国海警阻拦。

从2024年6月17日至2025年5月20日，菲律宾共进行了9次补给尝试，平均约40天一次。 但自5月20日至今已超过94天，远超以往间隔，推测驻守人员可能面临断粮困境。

中国在南海的建设和管理行动始终遵循国内法律法规和《联合国海洋法公约》等国际法，体现了法治化、规范化的海洋治理思路。 黄岩岛自然保护区的设立是中国有效维护自身领土主权、全面推进生态文明建设的重要一步。